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西農(nóng)大發(fā)表世界首個大規(guī)模 小麥 全基因組重測序研究結(jié)果

2019-07-23 16:28:09   

7月12日,西北農(nóng)林科技大學(xué)旱區(qū)作物逆境生物學(xué)國家重點實驗室在基因組學(xué)領(lǐng)域國際知名期刊Ge-nomeBiology上發(fā)表論文,揭示了六倍體小麥遺傳多樣性來源于頻繁的與野生小麥的種內(nèi)雜交及與更遠緣野草的種間雜交,為了解小麥起源、進化和馴化歷史,克服小麥遺傳資源同質(zhì)化,促進小麥遺傳改良提供了重要的數(shù)據(jù)資源。   作為國際小麥基因組測序聯(lián)盟(IW-GSC)成員,西北農(nóng)林科技大學(xué)2016年底率先獲得內(nèi)部共享尚未發(fā)表的六倍體小麥參考基因組的信息,開始對小麥遺傳多樣性來源這一重要命題開展了多學(xué)科、多團隊聯(lián)合攻關(guān),對來自全世界的93個野生小麥、六倍體農(nóng)家種和主栽品種開展全基因組重測序,面對高重復(fù)的多倍體基因組分析難題,通過開發(fā)新的分析流程,建立了全面的小麥變異組信息,揭示了全球最廣泛種植的作物——六倍體小麥各亞基因組的遺傳變異,群體內(nèi)和群體間的遺傳分化程度,馴化和改良階段的受選擇信號等全方位的變異系譜和變異來源。 

首個大規(guī)模全基因組重測序研究提供了目前為止數(shù)量最多、覆蓋最全的六倍體小麥及其野生祖先的基因組變異集合,特別是篩選出來自多個野生小麥群體和遠源物種的大量基因滲入,其中一些滲入片段在群體中出現(xiàn)的頻率在馴化或是隨后改良過程中發(fā)生顯著增加。頻率改變并與已知數(shù)量性狀連鎖區(qū)域重疊,提示這些片段在馴化和改良過程中可能扮演著重要角色。相關(guān)結(jié)果有助于更深入理解小麥遺傳多樣性和進化歷程,同時為進一步挖掘影響多種小麥表型相對應(yīng)的功能變異提供了寶貴資源。(通訊員 李曉春 王學(xué)鋒)

編輯:任靜

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