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全基因組選擇:育種技術(shù)的新寵

2020-12-14 09:27:25   

全基因組選擇:育種技術(shù)的新寵

圖表?!≠Y料圖

我們都是遠(yuǎn)古人類的后代,遠(yuǎn)古人類生存的主要方式是狩獵與采摘,能否活下來(lái),純粹依賴于大自然的饋贈(zèng)。我們的祖先在狩獵時(shí)俘獲了野獸的幼崽,由于肉太少,舍不得吃,先圈養(yǎng)起來(lái),等養(yǎng)大了再吃;在采摘時(shí)發(fā)現(xiàn)了植物的種子,在家附近進(jìn)行播種,不用跋山涉水就能采摘到植物食材。在長(zhǎng)期的實(shí)踐中,人們發(fā)現(xiàn)人為干預(yù)可以提高圈養(yǎng)和播種的動(dòng)植物食材的產(chǎn)量,這個(gè)過(guò)程構(gòu)成了現(xiàn)代動(dòng)植物品種的馴養(yǎng)和馴化歷史,也就是最古老樸素的育種。何為育種?育種就是按照人類的意愿,對(duì)已有動(dòng)植物品種繁衍后代的方式進(jìn)行人為干預(yù),讓其后代的產(chǎn)品向人類期望的方向進(jìn)行改變。干預(yù)動(dòng)植物物種繁衍后代的操作技術(shù)就是所謂的育種技術(shù)。今天我們談到的全基因組選擇,就是人類最新發(fā)明的育種技術(shù)中的一款新利器。

什么是全基因組選擇

從國(guó)外到國(guó)內(nèi)、從動(dòng)物到植物、從科學(xué)研究到產(chǎn)業(yè)應(yīng)用,全基因組選擇的熱度一直在上升,是生物種業(yè)領(lǐng)域當(dāng)之無(wú)愧的新明星。全基因組選擇的思想最早由Meuwissen教授等于2001年提出,在專業(yè)上可以這么來(lái)定義——“利用覆蓋全基因組的高密度分子標(biāo)記,結(jié)合表型記錄或系譜記錄對(duì)個(gè)體育種值進(jìn)行估計(jì),其假定這些標(biāo)記中至少有一個(gè)標(biāo)記與所有控制性狀的突變處于連鎖不平衡狀態(tài)。”

全基因組選擇可以簡(jiǎn)單地理解為最新、最準(zhǔn)確的育種技術(shù),涉及育種芯片、大數(shù)據(jù)、高性能計(jì)算等,是育種技術(shù)里新一代的“高、精、尖”技術(shù)。如果把育種技術(shù)帶來(lái)的遺傳改良速度與交通工具類比,則古代的“相畜”和傳統(tǒng)育種技術(shù)相當(dāng)于“馬車”和“蒸汽機(jī)車”,而全基因組選擇則是“高鐵”的速度。全基因組選擇作為最新的高精尖育種技術(shù),能夠從基因本質(zhì)上區(qū)分優(yōu)秀個(gè)體,涉及分子標(biāo)記、基因、連鎖不平衡、參考群、候選群等專業(yè)詞匯,非專業(yè)人士確實(shí)不好理解,這里我們用大家都熟悉的親子鑒定做類比來(lái)幫助大家了解什么是全基因組選擇(見圖表)。

為什么要用全基因組選擇育種

縱觀世界經(jīng)濟(jì)社會(huì)的發(fā)展歷史可以發(fā)現(xiàn),一個(gè)國(guó)家經(jīng)濟(jì)越發(fā)達(dá),其國(guó)民動(dòng)物蛋白食品消費(fèi)量就越大。因此,人均動(dòng)物蛋白消費(fèi)量大致反映了一個(gè)國(guó)家經(jīng)濟(jì)社會(huì)的發(fā)展水平。以處于東亞文化圈的日本為例,戰(zhàn)后日本經(jīng)濟(jì)社會(huì)高速發(fā)展,在過(guò)去50年里,日本國(guó)民主食消費(fèi)量減少了一半,而肉類消費(fèi)卻增長(zhǎng)了3倍多,奶類消費(fèi)增長(zhǎng)了5倍。

中國(guó)也正在經(jīng)歷著同樣的發(fā)展變化。近30年我國(guó)人均主食消費(fèi)量下降了40%,肉蛋奶的消費(fèi)量則增加了2倍。盡管如此,目前我國(guó)人均動(dòng)物蛋白消費(fèi)量仍遠(yuǎn)低于歐美主要發(fā)達(dá)國(guó)家。根據(jù)世界經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展經(jīng)驗(yàn),我國(guó)動(dòng)物蛋白食物的缺口很大,養(yǎng)殖業(yè)有著巨大的提升空間。另一方面,我國(guó)用8%的耕地養(yǎng)活了世界19%的人口,糧食壓力也始終存在。隨著我國(guó)經(jīng)濟(jì)社會(huì)的進(jìn)一步發(fā)展,人們對(duì)肉蛋奶的需求逐步增加,飼料用糧的壓力持續(xù)增加,人畜爭(zhēng)糧逐漸成為影響中國(guó)糧食安全的根本問(wèn)題。只有口糧和飼料用糧雙管齊下,我國(guó)糧食安全才能得到真正的保障。

種是養(yǎng)殖業(yè)的源頭,地位堪比“工業(yè)芯片”,如果種不行,會(huì)導(dǎo)致養(yǎng)殖業(yè)效率低下。目前,在我國(guó)養(yǎng)殖業(yè)的部分領(lǐng)域,有的畜種高端核心種質(zhì)仍然未擺脫依賴國(guó)外的不利境況。雖然我國(guó)糧食安全在產(chǎn)業(yè)鏈中下游取得了舉世矚目的偉大成就,但還沒從種的源頭上得到徹底解決。正因如此,習(xí)近平總書記在2013年就作出重要指示:“要下決心把民族種業(yè)搞上去,抓緊培育具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的優(yōu)良品種,從源頭上保障國(guó)家糧食安全”。優(yōu)良品種是通過(guò)育種途徑培育出來(lái)的,而育種則需要育種技術(shù)。與其他行業(yè)一樣,科技是產(chǎn)業(yè)發(fā)展最重要的推動(dòng)力,育種技術(shù)是支撐我國(guó)生物種業(yè)發(fā)展的核心所在,也是“藏肉于技”中“技”的最為重要的組成部分。全基因組選擇是最新一代的育種技術(shù),育種效率遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)傳統(tǒng)育種方法。所以,要培育具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的優(yōu)良品種,在畜禽等生物種業(yè)領(lǐng)域趕超歐美育種強(qiáng)國(guó),只有大力推進(jìn)全基因組選擇技術(shù)的科學(xué)研究和產(chǎn)業(yè)應(yīng)用才有可能實(shí)現(xiàn)。

全基因組選擇有哪些特點(diǎn)

與傳統(tǒng)育種方法相比,全基因組選擇最突出的優(yōu)勢(shì)是:“快、準(zhǔn)、高”。

“快”是指生產(chǎn)性能提升更快。尤其對(duì)于世代間隔較長(zhǎng)的畜禽,其新品種(系)的育成時(shí)間明顯縮短。

“準(zhǔn)”是指所選群體中的優(yōu)秀個(gè)體選得更準(zhǔn)。因?yàn)檫@種技術(shù)利用了基因組信息,遺傳評(píng)估準(zhǔn)確性更高,給待選個(gè)體的“好與壞”排隊(duì)排得更準(zhǔn)。

“高”是指育種收益高。就是育種收益與育種投入比例,因?yàn)檫x得準(zhǔn)、進(jìn)展快、輔助減少生產(chǎn)性能測(cè)定成本等,全基因組選擇反而可以更多地降低育種成本,實(shí)際育種收益要遠(yuǎn)高于傳統(tǒng)育種收益。

全基因組選擇對(duì)我國(guó)畜禽種業(yè)未來(lái)發(fā)展有何影響

全基因組選擇實(shí)際是指利用全基因組信息開展育種的一類方法的統(tǒng)稱。因此,我國(guó)可以獨(dú)立自主研發(fā)更新、更有效率的全基因組選擇方法,從科學(xué)研究、產(chǎn)業(yè)應(yīng)用兩方面著力,建立具有中國(guó)特色和優(yōu)勢(shì)的全基因組選擇方法體系。從種的源頭提高我國(guó)養(yǎng)殖業(yè)的生產(chǎn)效率,保質(zhì)保量保障國(guó)民食材安全;從畜禽產(chǎn)業(yè)的源頭發(fā)力,把我國(guó)建設(shè)成為世界畜禽種業(yè)強(qiáng)國(guó)。

(作者單位:華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 全國(guó)畜牧總站)

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