2023-12-11 09:04:14
在2023年12月8-10日的“2023羊業(yè)發(fā)展高級研討會”上,中國農業(yè)大學動物科技學院韓紅兵團隊、天津奧群牧業(yè)有限公司、華智生物技術有限公司聯(lián)合發(fā)布了綿羊40K液相育種芯片——“白澤一號”。該芯片覆蓋了澳洲白、杜泊羊、湖羊和東弗里升羊等主流種用綿羊品種,包含了40000多個高質量SNP位點,可在綿羊遺傳多樣性評估、遺傳圖譜構建及基因定位、種質資源鑒定、親緣鑒定、全基因組關聯(lián)分析、全基因組選擇等不同場景中深度應用,開展重要經濟性狀改良,加速綿羊育種進程。
1、降低全基因組選擇育種成本
2、提高品種改良育種效率
3、精準鑒定種質資源潛力和品種親緣關系
4、應用的綿羊品種廣泛,包括澳洲白、杜泊羊、湖羊和東弗里升羊等品種
1、位點多態(tài)性好、基因組分布均勻
通過對多樣性豐富的主流種用綿羊品種進行全基因組重測序,篩選獲得高多態(tài)SNP位點20,730個,平均MAF值為0.37;挖掘整合遺傳效應顯著位點和品種特異位點20,381個,共同構成綿羊40K cGPS液相育種芯片;位點均勻分布于染色體(見圖1)。
圖1 綿羊40K cGPS液相育種芯片SNP標記在染色體上的分布
2、功能位點及品種特異性位點豐富
芯片包含澳洲白、杜泊羊、湖羊和東弗里升羊等品種特異性位點,涵蓋生長、肉質、繁殖、體型、毛發(fā)、抗病、屠宰、產奶等多類功能分子標記位點20,381個(見圖2),可進行生長、肉質和抗病等重要性狀基因的挖掘利用。
圖2 綿羊40K cGPS液相育種芯片功能位點統(tǒng)計
1、綿羊遺傳多樣性評估
2、種質資源和親緣關系鑒定
3、分子設計育種
4、遺傳圖譜構建及基因定位
5、全基因組關聯(lián)分析
6、全基因組選擇
1、中國農業(yè)大學動物科學技術學院韓紅兵團隊
中國農業(yè)大學動物科學技術學院韓紅兵團隊長期以來從事羊遺傳育種研究。主要圍繞羊生長、抗病等重要經濟性狀功能基因挖掘,基因編輯與基因組育種技術,以及肉羊品種培育開展研究工作,在eLife、Microbiome、Commun Biol等權威雜志發(fā)表SCI論文60余篇,授權發(fā)明專利14件。
2、天津奧群牧業(yè)有限公司
天津奧群牧業(yè)有限公司是國家高新技術企業(yè),國家種業(yè)陣型企業(yè),多年來,深耕于肉羊育種領域,潛心服務于中國“種業(yè)振興”偉大戰(zhàn)略,傾力打造中國未來羊業(yè)“芯片”。
3、華智生物技術有限公司
華智生物是在農業(yè)農村部倡導以及國家發(fā)改委、科技部、湖南省等相關部省委支持下,由中信農業(yè)、隆平高科等十余家龍頭種企和專業(yè)機構共同組建的、我國領先的第三方生物種業(yè)關鍵共性技術平臺和國家級分子育種創(chuàng)新服務平臺,入選國家農作物、畜禽、水產三大類種業(yè)陣型專業(yè)化平臺企業(yè)和首批20家種業(yè)打假維權種子檢測機構推薦名單。
華智生物融合生物技術(BT)與數據技術(DT),為客戶提供基因型鑒定、種質資源鑒定評價、性狀基因創(chuàng)制挖掘鑒定、生物信息分析、種質創(chuàng)新創(chuàng)制、分子和智能育種、生物智能大數據管理和應用、品種測試評價、種子質量/土壤環(huán)境/農產品安全檢驗檢測、生物技術法規(guī)服務等全鏈條、一站式綜合解決方案。華智生物的產品和技術服務貫穿種業(yè)全產業(yè)鏈,覆蓋了農作物、畜禽、水產、果蔬、林木、花草、中藥材、微生物等200多個物種領域,每年為近800家單位和團隊提供服務,年完成服務合同1,000余份,年檢測樣品超過100萬份。