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陜西省水產研究與技術推廣總站率先完成黃河生物名片蘭州鲇染色體水平上的全基因組測序

2024-01-04 09:46:06   

近日,陜西省水產研究與技術推廣總站蘭州鲇研究團隊率先完成并發(fā)表了“黃河生物名片”蘭州鲇全基因組圖譜,這是第一個有關黃河瀕危魚類蘭州鲇染色體水平上的全基因組序列。該項工作的完成,將提供大量與蘭州鲇重要性狀相關的功能基因,有利于從功能基因組角度揭示蘭州鲇生長、發(fā)育、代謝、免疫等重要生命現(xiàn)象的分子機制,為進一步探究其瀕危的內在因素奠定基礎,對于我國黃河流域的生態(tài)環(huán)境保護、生物多樣性保護以及漁業(yè)資源的可持續(xù)利用都有著重要的實踐價值。

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蘭州鲇基因組圖譜

據(jù)了解,蘭州鲇是中國特有瀕危魚類物種,僅分布在黃河中上游河段,在黃河生態(tài)系統(tǒng)中占據(jù)重要地位,已被列入中國十大河流水生生物名片。其基因組由30條染色體組成,全長794.43 Mb。研究表明,蘭州鲇的特有基因家族主要富集在氨基酸代謝相關通路中。此外,研究發(fā)現(xiàn)蘭州鲇趨化因子受體和清道夫受體基因家族發(fā)生收縮,這可能與其較低的免疫反應有關。這一發(fā)現(xiàn)為研究蘭州鲇的瀕危機制提供了寶貴的見解。

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陜西省水產研究與技術推廣總站(黃河水產研究所)長期致力于蘭州鲇的保護與可持續(xù)利用研究工作,先后從群體、個體、分子、遺傳和生化等層面全面科學地揭示了蘭州鲇的種質特性,研究了蘭州鲇瀕危的環(huán)境因素和資源衰退的遺傳學機制,發(fā)表學術論文20余篇,制定水產行業(yè)標準《蘭州鲇》1項,部分成果曾被鑒定為“國際先進水平”,并獲陜西科技進步獎2項。此次蘭州鲇全基因組圖譜繪制和發(fā)表,為進一步探究黃河魚類物種適應性進化及種質資源保護利用奠定了基礎,從而對制定更加科學合理的保護措施具有指導意義。

知識鏈接

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蘭州鲇(Silurus lanzhouensis)又名黃河鯰 ,隸屬于鲇形目(Siluriformes)、鲇科(Siluridea)、鲇屬(Silurus),營養(yǎng)價值高,俗有"黃河鯰魚活人參"之稱,具有十分廣闊的養(yǎng)殖前景。黃河寧夏段是其典型分布區(qū),但由于水體污染、過度捕撈、水利工程建設等因素,蘭州鲇野生種群日趨衰退,已被《中國物種紅色名錄》列為瀕危物種。

蘭州鲇體長,頭較為扁平,體表光滑無鱗,皮膚富于粘液,側線上有一行粘液孔。眼小,口橫寬而大,下頜突出,須2對,頜須長超過胸鰭基部。體后部側扁??诹涯┒伺c眼前緣相對。背鰭小,胸鰭刺后緣鋸齒極其微弱。

蘭州鲇屬于肉食性魚類,常棲息于河流緩流處或靜水中下層,多在黃昏和夜間活動;4月下旬到5月中旬繁殖。在我國分布于黃河水系的蘭州及內蒙古托克托縣和巴彥淖爾盟四分灘,黃河陜西段有一定的資源量。從營養(yǎng)學角度上,蘭州鲇是一種營養(yǎng)價值較高的優(yōu)質魚類,肌肉(鮮樣)中粗蛋白質量分數(shù)(17.4±0.7)%,粗脂肪(2.22±1.09)%,粗灰分(1.12±0.09)%,水分(80.4±0.8)%。肌肉中含有18種氨基酸,總量為(71.29±3.71)%(質量分數(shù),干樣),其中含量最高的為谷氨酸(10.43±0.47)%,含量最低的為胱氨酸(0.663±0.040)%,8種人體必需氨基酸總量為(30.24±2.18)%,占氨基酸總量的42.38%,其構成比例符合FAO/WHO標準。蘭州鲇肌肉中限制性氨基酸為纈氨酸、亮氨酸和異亮氨酸,必需氨基酸指數(shù)(EAAI)為69.3,4種鮮味氨基酸總質量分數(shù)為24.62%(干樣);磷含量顯著高于其余12種礦物元素(p<0.05),鋅在8種微量元素中含量(10.18mg/kg,鮮樣)最高,鐵(8.31mg/kg,鮮樣)次之,硒含量(0.31mg/kg,鮮樣)豐富。

蘭州鲇不飽和脂肪酸占脂肪酸總量的65.21%,并以油酸(C18:1)和亞油酸(C18:2)為主;脂肪酸中多不飽和脂肪酸(PUFA)占總脂肪酸的33.39%,二十碳五烯酸(EPA)與二十二碳六烯酸(DHA)的含量分別為5.12%、7.65%。

農業(yè)科技報·中國農科新聞網(wǎng)記者 馮玉龍

來源:中國農科新聞網(wǎng)
編輯:于婷婷
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