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全球首個(gè)!重慶發(fā)布血橙高質(zhì)量基因組

2024-05-29 14:46:23   

近日,國際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《Scientific Data》(中文譯名《科學(xué)數(shù)據(jù)》)發(fā)表重慶市農(nóng)科院果樹所柑橘創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)(以下簡稱柑橘創(chuàng)新團(tuán)隊(duì))學(xué)術(shù)論文《重要甜橙品種——血橙高質(zhì)量染色體級別基因組》,首次在國際上公開發(fā)布血橙高質(zhì)量基因組。

“基因檢測完整性達(dá)到98.2%,在基因組研究領(lǐng)域被評價(jià)為一組高質(zhì)量基因組。”論文牽頭人、柑橘創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)首席專家洪林告訴記者。

血橙屬于甜橙類品種,酸甜適度、風(fēng)味濃郁,富含的花青素能為人體帶來多種益處,深受消費(fèi)者青睞。重慶市特色水果產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)首席專家、市農(nóng)技站果樹科科長孔文斌研究員介紹,國內(nèi)血橙主要分布在川渝地區(qū),種植總面積超過100萬畝,其中重慶有40余萬畝,居全市柑橘產(chǎn)業(yè)第二,涉及果農(nóng)10萬戶左右。

重慶發(fā)布全球首個(gè)高糖血橙高質(zhì)量基因組

“塔羅科”新系血橙是重慶市血橙的主栽品種。

重慶發(fā)布全球首個(gè)高糖血橙高質(zhì)量基因組

“塔羅科”新系血橙。

據(jù)了解,目前國內(nèi)種植的血橙多為意大利“塔羅科”血橙變異而來的“塔羅科”新系,這個(gè)品種推廣已有10余年。為改良品種,近年來,柑橘創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)一直在潛心開展血橙新品種選育,他們在重慶血橙主產(chǎn)區(qū)開展了一輪又一輪“海選”,試圖找到優(yōu)異的育種資源。2019年,他們在育種資源中偶然發(fā)現(xiàn)了一株自然變異株,其花青素含量更高,血色更深,糖度也更高。

利用該變異株,柑橘創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在江津、開州、萬州的試驗(yàn)基地對12畝共500多棵血橙樹進(jìn)行了嫁接,隨后逐年記錄果實(shí)產(chǎn)量、甜度、花青素含量,以及果樹的抗病性能等100余項(xiàng)數(shù)據(jù)。

經(jīng)過連續(xù)4年試驗(yàn)觀察,柑橘創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)其性狀穩(wěn)定、特色鮮明,目前正在申請國家新品種權(quán)保護(hù)和品種登記,暫命名為“內(nèi)秀”。

重慶發(fā)布全球首個(gè)高糖血橙高質(zhì)量基因組

“內(nèi)秀”血橙。

重慶發(fā)布全球首個(gè)高糖血橙高質(zhì)量基因組

“內(nèi)秀”血橙血色更深,花青素含量更高。

“它的優(yōu)異性狀十分突出!” 西南大學(xué)園藝園林學(xué)院曾明教授表示,“經(jīng)檢測,這個(gè)由變異株產(chǎn)生的血橙新品系,果實(shí)甜度為14.7,花青素含量為每升52.34毫克,都比目前主推品種‘塔羅科’新系要高,產(chǎn)量則與之相當(dāng)?!?/p>

洪林說,新品系血橙的優(yōu)異性狀是由自然變異而來,團(tuán)隊(duì)想搞清楚究竟是什么基因在起作用,而國際上尚未有公開發(fā)布的高質(zhì)量血橙基因組,于是柑橘創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)采用三代基因測序技術(shù),著手“內(nèi)秀”血橙全基因組測序工作。他介紹,“這次血橙基因測序深度達(dá)到65×,共預(yù)測到30395個(gè)基因。65×的深度可以很好地覆蓋基因組的完整信息,這意味著我們檢測到的基因完整度、精確度更高。目前完整性達(dá)到98.2%,可以說是一組高質(zhì)量的基因組?!?/p>

洪林還表示,對該基因組的深入研究,將不斷揭開血橙基因的奧秘,有望挖掘到更多優(yōu)異的遺傳基因,從而培育出更多的優(yōu)良血橙品種。

來源:農(nóng)民日報(bào)客戶端
編輯:牛姣
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