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全球首個!重慶發(fā)布血橙高質量基因組

2024-05-29 14:46:23   

近日,國際權威學術期刊《Scientific Data》(中文譯名《科學數據》)發(fā)表重慶市農科院果樹所柑橘創(chuàng)新團隊(以下簡稱柑橘創(chuàng)新團隊)學術論文《重要甜橙品種——血橙高質量染色體級別基因組》,首次在國際上公開發(fā)布血橙高質量基因組。

“基因檢測完整性達到98.2%,在基因組研究領域被評價為一組高質量基因組?!闭撐臓款^人、柑橘創(chuàng)新團隊首席專家洪林告訴記者。

血橙屬于甜橙類品種,酸甜適度、風味濃郁,富含的花青素能為人體帶來多種益處,深受消費者青睞。重慶市特色水果產業(yè)技術體系創(chuàng)新團隊首席專家、市農技站果樹科科長孔文斌研究員介紹,國內血橙主要分布在川渝地區(qū),種植總面積超過100萬畝,其中重慶有40余萬畝,居全市柑橘產業(yè)第二,涉及果農10萬戶左右。

重慶發(fā)布全球首個高糖血橙高質量基因組

“塔羅科”新系血橙是重慶市血橙的主栽品種。

重慶發(fā)布全球首個高糖血橙高質量基因組

“塔羅科”新系血橙。

據了解,目前國內種植的血橙多為意大利“塔羅科”血橙變異而來的“塔羅科”新系,這個品種推廣已有10余年。為改良品種,近年來,柑橘創(chuàng)新團隊一直在潛心開展血橙新品種選育,他們在重慶血橙主產區(qū)開展了一輪又一輪“海選”,試圖找到優(yōu)異的育種資源。2019年,他們在育種資源中偶然發(fā)現了一株自然變異株,其花青素含量更高,血色更深,糖度也更高。

利用該變異株,柑橘創(chuàng)新團隊在江津、開州、萬州的試驗基地對12畝共500多棵血橙樹進行了嫁接,隨后逐年記錄果實產量、甜度、花青素含量,以及果樹的抗病性能等100余項數據。

經過連續(xù)4年試驗觀察,柑橘創(chuàng)新團隊發(fā)現其性狀穩(wěn)定、特色鮮明,目前正在申請國家新品種權保護和品種登記,暫命名為“內秀”。

重慶發(fā)布全球首個高糖血橙高質量基因組

“內秀”血橙。

重慶發(fā)布全球首個高糖血橙高質量基因組

“內秀”血橙血色更深,花青素含量更高。

“它的優(yōu)異性狀十分突出!” 西南大學園藝園林學院曾明教授表示,“經檢測,這個由變異株產生的血橙新品系,果實甜度為14.7,花青素含量為每升52.34毫克,都比目前主推品種‘塔羅科’新系要高,產量則與之相當?!?/p>

洪林說,新品系血橙的優(yōu)異性狀是由自然變異而來,團隊想搞清楚究竟是什么基因在起作用,而國際上尚未有公開發(fā)布的高質量血橙基因組,于是柑橘創(chuàng)新團隊采用三代基因測序技術,著手“內秀”血橙全基因組測序工作。他介紹,“這次血橙基因測序深度達到65×,共預測到30395個基因。65×的深度可以很好地覆蓋基因組的完整信息,這意味著我們檢測到的基因完整度、精確度更高。目前完整性達到98.2%,可以說是一組高質量的基因組?!?/p>

洪林還表示,對該基因組的深入研究,將不斷揭開血橙基因的奧秘,有望挖掘到更多優(yōu)異的遺傳基因,從而培育出更多的優(yōu)良血橙品種。

來源:農民日報客戶端
編輯:牛姣
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